大病医疗专项附加扣除需在2026年3—6月汇算清缴时填报，操作分四步：一、个税App填报（选2026年度→大病医疗→核对信息→确认预填或手动修正→提交）；二、国家医保服务平台查2025年费用是否超15000元且结算在年内；三、留存票据、结算单等备查资料五年；四、委托单位代报须在2026年1月起发薪前提交信息表。
如果您在年度汇算清缴期间需申报大病医疗专项附加扣除，但尚未完成信息填报，则可能是由于未通过个人所得税App正确进入填报流程或医保数据未同步导致预填失败。以下是申报此扣除项目的具体操作步骤：
一、通过个人所得税App填报大病医疗信息
该方法适用于所有纳税人，系统可自动调取国家医保服务平台的结算数据，减少手动录入误差，确保金额准确。
1、打开个人所得税App，点击首页【办&查】—【专项附加扣除填报】；
2、选择扣除年度为2026年，点击【大病医疗】；
3、阅读填报提示后勾选“准备完毕，进入填报”，进入信息填写界面；
4、核对【本人信息】无误后点击【下一步】，确认提示内容并点击【我知道了】；
5、在【医疗信息】页面，系统将自动预填医保结算单上的医药费用总金额和医保目录范围内个人负担的自付金额；
6、如预填金额与实际票据不符，可手动修改，并留存相关票据原件备查；
7、选择扣除主体（本人、配偶或未成年子女），确认关系及身份信息；
8、选择【申报方式】为“通过扣缴义务人申报”或“综合所得年度汇算申报”，点击【提交】。
二、使用国家医保服务平台APP查询并核对费用数据
该方法用于验证医保系统是否已归集符合条件的医疗支出，避免因数据延迟或遗漏导致无法享受扣除。
1、下载并登录国家医保服务平台App；
2、点击【个人医保信息】—【年度费用汇总】；
3、选择年度为2025年（对应2026年汇算清缴）；
4、查看【医保目录范围内个人负担累计金额】是否超过15000元；
5、确认每笔费用的结算时间是否在2025年1月1日至2025年12月31日期间；
6、若存在跨年度结算（如2025年末住院、2026年初出院），则该笔费用计入2026年汇算清缴所属年度，不参与本次填报。
三、线下准备并留存备查资料
该方法用于应对系统未自动获取数据或税务机关后续核查的情形，确保扣除资格真实有效。
1、收集全部医疗收费票据原件或加盖医院公章的复印件；
2、整理医保报销结算单，重点标注医保目录范围内个人负担的自付金额；
3、核对票据上的患者姓名、身份证件号码与个税App填报信息一致；
4、若为配偶或未成年子女支出，需同时提供关系证明（如结婚证、户口簿页）；
5、将上述资料按年度归档，自2026年6月30日法定汇算期结束后保存满五年。
四、委托扣缴义务人代为申报
该方法适用于希望按月享受预扣预缴减免的纳税人，需在年度开始前完成信息报送，不适用于仅在年度汇算时申请退税的情形。
1、在2026年1月起的任一发薪日前，向单位人事或财务部门提交《个人所得税专项附加扣除信息表》；
2、表格中须完整填写患者姓名、身份证件类型及号码、与纳税人关系、医疗费用总金额、个人负担金额；
3、附上医保结算单关键页复印件，并由纳税人签字确认；
4、单位在自然月申报期内通过自然人电子税务局【扣缴客户端】上传信息；
5、系统校验通过后，当月起工资薪金预扣税款将按扣除后基数计算。
