答案:在PubMed导出文献需选择合适格式。先检索并勾选文献,点击“Send to”,选“Citation manager”导出RIS格式用于EndNote、Zotero等软件;或选“File”后设格式为MEDLINE以获取详细信息文本;也可选PMID格式导出编号列表用于编程处理。

如果您在PubMed中检索到所需文献,需要将其信息保存或导入文献管理软件,则必须选择合适的导出格式。不同的格式适用于不同的用途和软件。以下是关于如何在PubMed官网选择导出格式并保存数据的具体方法:
一、使用RIS格式导出至文献管理软件
RIS格式是一种通用的引文文件格式,被EndNote、Zotero、Mendeley等多种文献管理工具广泛支持。选择此格式可以确保文献的元数据(如作者、标题、期刊、摘要等)被完整地导入到您的参考文献库中。
1、在PubMed中输入关键词进行搜索,得到结果列表。
2、勾选您需要导出的文献前的复选框,或点击“Show 20 per page”旁边的下拉菜单选择每页显示数量,然后勾选“all”以选择当前页面所有结果。
3、点击页面上方的Send to按钮,在下拉菜单中选择Citation manager。
4、系统会自动将选中文献打包为RIS格式文件并开始下载,文件通常命名为citation.sis或类似名称。
5、将下载的文件直接拖入Zotero、Mendeley等软件,或在EndNote中通过“File”→“Import”功能导入即可完成文献收录。
二、以MEDLINE文本格式批量导出文献详情
MEDLINE格式是PubMed提供的纯文本格式,包含了比一般引用更详尽的信息字段,例如完整的作者列表、地址、出版状态、MeSH关键词等,适合用于深度文献分析或需要原始数据的研究场景。
1、完成文献检索后,在结果页面选择您要导出的条目,可单选或多选。
2、点击Send to下拉菜单,选择File选项。
3、在弹出的窗口中,“Format”部分请选择MEDLINE而非默认的“PubMed Format”。
4、点击Create File按钮,浏览器将生成并下载一个包含所有选定文献详细记录的文本文件。
5、该文件可用记事本、VS Code或其他文本编辑器打开,便于查看结构化数据或进行批量处理。
三、导出PMID编号列表用于后续自动化处理
PMID(PubMed唯一标识符)是一串数字编号,每个文献都有唯一的PMID。导出PMID列表常用于编程调用NCBI API获取数据、构建数据库或在其他平台批量查询文献。
1、在搜索结果页,使用复选框选择目标文献,或使用“All”全选当前页面内容。
2、点击Send to,然后选择File。
3、在格式(Format)下拉菜单中,选择PMID选项。
4、点击Create File,系统将生成一个仅包含所选文献PMID的纯文本文件,每行一个编号。
5、此列表可用于脚本读取,配合E-utilities等工具实现大规模文献信息抓取。










